木瓜不能和蝦搭配在一起吃，這兩種食物搭配一起容易導致腹部疼痛，頭暈現象出現。蝦含有一種對人體無害的砷，與木瓜的維生素C相遇會轉化爲有毒的。
木瓜也不能和油炸食物搭配在一起吃，很多人在吃完油炸食物以後就喜歡吃一些水果解除油膩預防上火，其實這樣做是比較危險的。木瓜不宜和油炸食物一起吃，吃了會出現肚子疼，拉肚子的現象。所以吃油炸食物後不宜吃木瓜。
木瓜也不能和韭菜搭配在一起吃，韭菜裏面含有非常豐富的纖維素，可以讓腸道蠕動速度變得更快，也可以治療便祕問題，可以幫助身體排毒，預防腹部堆積過多脂肪。但韭菜與木瓜相剋，韭菜、木瓜性溫熱，同食易上火。所以爲了避免上火，最好不要同時食用這兩種食物。
木瓜不能和南瓜一起吃，會降低營養價值。由於南瓜含維生素C分解酶，而木瓜中維生素C的含量非常高，是蘋果的48倍，成人每天吃木瓜100克(約半個中型木瓜)，即可滿足對維生素c的需要。所以南瓜不宜同富含維生素C的木瓜同食。否則會破壞其大量維生素C，降低營養價值。維生素C耐熱，南瓜煮熟後此酶即被破壞。所以南瓜宜煮食，不宜炒食，更不宜與木瓜同炒。
