1.遺傳
遺傳因素是導致重度智力低下的主要原因之一，在發達國家由遺傳疾病所致的智力低下佔重度智力低下總數的一半以上。
2.感染和難產
出生前原因孕婦妊娠前4個月若感染風疹病毒，流感和其他病毒性疾病，對胎兒和嬰兒危害極大，可造成胎兒先天畸形和智力障礙。
3.疾病
先天愚型又稱唐氏綜合徵，是由於染色體異常造成的。呆小病又稱先天性甲狀腺功能不全。由於甲狀腺發育異常不能合成甲狀腺素，影響了大腦發育所致。苯丙酮尿症是由於酶的缺陷，攝入的苯丙氨酸代謝受阻，引起腦細胞功能障礙。貓叫綜合徵是由於體內染色體出了問題。
4.社會以及家庭心理因素
早期社會隔絕、情感人爲剝奪、缺乏母愛、無人照料、文化閉塞、不適當的教導方式等均可影響孩子的智力水平。在社會經濟地位高、家庭結構穩定、母親受過良好教育的家庭中，兒童的智力水平高於那些相關條件差的孩子。其他因素如大家庭、多子女、出生間隔時間短、雙生子和父母離異等，均對兒童的智力發育有直接影響。
5.營養
研究表明，孕期營養不良是宮內胎兒生長遲滯的主要原因之一。凡母親營養不良者，小兒體格發育均明顯遲緩，這類小兒常伴有智能低、行爲障礙或其他方面的障礙。
